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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  33 lines
  1. ****************************************************
  2. * Ribonucleotide reductase small subunit signature *
  3. ****************************************************
  4.  
  5. Ribonucleotide reductase (EC 1.17.4.1) [1,2] catalyzes the reductive synthesis
  6. of deoxyribonucleotides from their  corresponding ribonucleotides. It provides
  7. the precursors necessary  for  DNA synthesis.   Ribonucleotide reductase is an
  8. oligomeric enzyme  composed of a  large  subunit (700 to 1000 residues)  and a
  9. small subunit (300 to 400 residues).
  10.  
  11. The small chain binds  two iron atoms [3] (three Glu, one Asp, and two His are
  12. involved in metal binding) and contains an active  site tyrosine radical.  The
  13. regions of the sequence that contain the metal-binding residues and the active
  14. site tyrosine are  conserved  in  ribonucleotide  reductase  small  chain from
  15. prokaryotes, eukaryotes and viruses.
  16.  
  17. We have selected one of these regions as a signature pattern.  It contains the
  18. active site  residue  as  well  as a glutamate and a histidine involved in the
  19. binding of iron.
  20.  
  21. -Consensus pattern: E-x-[LIVTA]-H-x(3)-Y-x(2)-[LIVQ]-x(3)-[LIVMFY](2)
  22.                     [E and H bind iron, Y is the active site residue]
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 3.
  25. -Last update: October 1993 / Text revised.
  26.  
  27. [ 1] Nillson O., Lundqvist T., Hahne S., Sjoberg B.-M.
  28.      Biochem. Soc. Trans. 16:91-94(1988).
  29. [ 2] Reichard P.
  30.      Science 260:1773-1777(1993).
  31. [ 3] Nordlund P., Sjoberg B.-M., Eklund H.
  32.      Nature 345:593-598(1990).
  33.